Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms