Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV1

Pam16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pam16Q9CQV1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pam16Q9CQV1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pam16Q9CQV1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pam16Q9CQV1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pam16Q9CQV1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pam16Q9CQV1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pam16Q9CQV1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pam16Q9CQV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms