Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rer1Q9CQU3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rer1Q9CQU3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms