Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim8Q9CQQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim8Q9CQQ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms