Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed6Q9CQG0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms