Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTRAFQ9CQE8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTRAFQ9CQE8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTRAFQ9CQE8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms