Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sar1bQ9CQC9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sar1bQ9CQC9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sar1bQ9CQC9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms