Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd1Q9CQA6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd1Q9CQA6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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