Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpa3Q9CQ71 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpa3Q9CQ71 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms