Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
StambpQ9CQ26 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
StambpQ9CQ26 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
StambpQ9CQ26 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms