Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms