Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms