Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt88Q9CPR6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt88Q9CPR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms