Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bcl11bQ99PV8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bcl11bQ99PV8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bcl11bQ99PV8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bcl11bQ99PV8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bcl11bQ99PV8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bcl11bQ99PV8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bcl11bQ99PV8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bcl11bQ99PV8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Bcl11bQ99PV8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Bcl11bQ99PV8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Bcl11bQ99PV8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms