Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim12aQ99PQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim12aQ99PQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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