Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Scd3Q99PL7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scd3Q99PL7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms