Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cep41Q99NF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cep41Q99NF3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms