Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmfQ99NF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NsmfQ99NF2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NsmfQ99NF2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms