Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bco2Q99NF1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bco2Q99NF1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bco2Q99NF1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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