Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms