Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cadm3Q99N28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cadm3Q99N28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cadm3Q99N28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms