Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac9Q99N13 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac9Q99N13 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac9Q99N13 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms