Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrrtQ99MR6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SrrtQ99MR6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SrrtQ99MR6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms