Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp1b4Q99ME6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp1b4Q99ME6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Atp1b4Q99ME6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms