Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gins4Q99LZ3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gins4Q99LZ3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms