Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nus1Q99LJ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nus1Q99LJ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms