Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rcbtb2Q99LJ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms