Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cstf3Q99LI7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms