Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PpifQ99KR7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PpifQ99KR7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms