Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf19Q99KJ5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tcf19Q99KJ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcf19Q99KJ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tcf19Q99KJ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms