Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Me2Q99KE1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Me2Q99KE1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms