Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apobec3Q99J72 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apobec3Q99J72 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apobec3Q99J72 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apobec3Q99J72 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms