Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mcoln1Q99J21 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mcoln1Q99J21 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms