Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smc6Q924W5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smc6Q924W5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smc6Q924W5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smc6Q924W5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smc6Q924W5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smc6Q924W5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smc6Q924W5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms