Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Clip1Q922J3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Clip1Q922J3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Clip1Q922J3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms