Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bp4Q921I6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bp4Q921I6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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