Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HlcsQ920N2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
HlcsQ920N2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HlcsQ920N2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms