Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6cQ91ZQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms