Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl3Q91YH5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl3Q91YH5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms