Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps36Q91XD6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps36Q91XD6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps36Q91XD6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms