Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lims2Q91XD2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lims2Q91XD2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms