Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT4

Dnajc17, DnaJ homolog subfamily C member 17, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc17Q91WT4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc17Q91WT4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc17Q91WT4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc17Q91WT4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc17Q91WT4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms