Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Setd3Q91WC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Setd3Q91WC0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd3Q91WC0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd3Q91WC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd3Q91WC0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd3Q91WC0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd3Q91WC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd3Q91WC0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms