Protein–RNA interactions for Protein: Q91V81

Rbm42, RNA-binding protein 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm42Q91V81 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm42Q91V81 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbm42Q91V81 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbm42Q91V81 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbm42Q91V81 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm42Q91V81 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm42Q91V81 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm42Q91V81 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm42Q91V81 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm42Q91V81 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbm42Q91V81 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms