Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacng5Q8VHW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cacng5Q8VHW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacng5Q8VHW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacng5Q8VHW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacng5Q8VHW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacng5Q8VHW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms