Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms