Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ankrd49Q8VE42 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd49Q8VE42 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd49Q8VE42 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms