Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd2Q8VDM4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd2Q8VDM4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd2Q8VDM4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms