Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alg12Q8VDB2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Alg12Q8VDB2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms