Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgip1Q8VD37 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgip1Q8VD37 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgip1Q8VD37 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgip1Q8VD37 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgip1Q8VD37 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgip1Q8VD37 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sgip1Q8VD37 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgip1Q8VD37 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sgip1Q8VD37 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgip1Q8VD37 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms